Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cavin1O54724 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms