Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pik3cdO35904 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms