Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clk2O35491 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clk2O35491 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms