Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms