Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2O35245 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms