Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc23O35125 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc23O35125 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms