Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3cO35066 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3cO35066 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms