Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms