Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms