Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms