Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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Gm20878L7N244 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gm20878L7N244 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20878L7N244 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20878L7N244 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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