Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms