Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc180J3QNE4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms