Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20918J3QN17 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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