Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3336J3QMQ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms