Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lipo1J3QME6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lipo1J3QME6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms