Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3727J3QM54 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3727J3QM54 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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