Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms