Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Pabpc4lG5E8X2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc4lG5E8X2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms