Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms