Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Arfgef1G3X9K3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms