Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd5G3UW60 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd5G3UW60 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd5G3UW60 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd5G3UW60 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd5G3UW60 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd5G3UW60 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms