Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ScaperF8VQ70 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms