Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms