Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crocc2F6XLV1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms