Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms