Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms