Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930546C10RikE9Q4Y3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms