Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms