Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930523C07RikE9Q2T4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930523C07RikE9Q2T4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms