Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8237E9Q257 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8237E9Q257 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms