Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms