Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms