Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4450E9Q007 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm4450E9Q007 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms