Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms