Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms