Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms