Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms