Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms