Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC035044E0CXF8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC035044E0CXF8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC035044E0CXF8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC035044E0CXF8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC035044E0CXF8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC035044E0CXF8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC035044E0CXF8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC035044E0CXF8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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