Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms