Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms