Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam47eD3YWC7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms