Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsperg2C6KI89 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms