Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11bB4XVQ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Phf11bB4XVQ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Phf11bB4XVQ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11bB4XVQ1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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