Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms