Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr3aB2RXC6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms