Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms