Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms