Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5483B2RV77 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5483B2RV77 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms